Started by timer Building on master in workspace /var/lib/jenkins/workspace/wrf-spp executing script: set -v renice 15 $$ # do all of this nicely since it's a long compile and set of cp for the input data cd ~/scratch rm -rf wrf-spp mkdir wrf-spp lfs setstripe -c 8 wrf-spp lfs getstripe wrf-spp cd wrf-spp/ tar xvf ~/wrf-spp/wrf.tar cd wrf/WRFV3/ time ./buildit cd ~/scratch/wrf-spp/wrf cp ~/wrf-spp/*.tac . MYJOBID=`./qsub.*.tac 64 114 16 2 4 a | tail -1` echo my job is $MYJOBID ~arnoldg/ior/wait_for.sh $MYJOBID #echo "check for jobid manually and monitor progress, then check the output directory in ~bwjenkins/scratch/wrf-spp/APRIL_23..." ######## renice 15 $$ # do all of this nicely since it's a long compile and set of cp for the input data cd ~/scratch rm -rf wrf-spp 50631 (process ID) old priority 0, new priority 15 mkdir wrf-spp lfs setstripe -c 8 wrf-spp lfs getstripe wrf-spp cd wrf-spp/ tar xvf ~/wrf-spp/wrf.tar wrf-spp stripe_count: 8 stripe_size: 1048576 stripe_offset: -1 wrf/ wrf/LANDUSE.TBL wrf/URBPARM.TBL wrf/namelist.input.proto.make_rst wrf/runit.xe.omp wrf/runit.xe.omp.quilt.hera wrf/GENPARM.TBL wrf/t wrf/mmm wrf/m wrf/m2.out wrf/qsub.xe.omp.scale.ideal.raf2 wrf/namelist.ARWpost wrf/runit.iowrf wrf/MASTER_LAUNCH wrf/read_wrf_nc wrf/LLL2 wrf/junk2 wrf/grid_order_pj wrf/qsub.xe.omp.scale.ideal.tac wrf/runit.xe.omp.scale.ideal wrf/XZ.none.o446633 wrf/List wrf/test1.pbs 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wrf/runit.xe.omp.scale.ideal.raf_pat wrf/LL2 wrf/e1 wrf/stats.awk wrf/mm wrf/runit.xe wrf/namelist.input.proto wrf/SOILPARM.TBL wrf/wrfbdy_d01 wrf/sizes wrf/runit.xe.omp.scale wrf/runit.xe.omp.scale.ideal.tac wrf/README.namelist wrf/VEGPARM.TBL wrf/namelist.input.proto.rst wrf/qsub.xe.omp.affin wrf/mmm.3 wrf/324.pbs wrf/runit.xk.omp wrf/WRFV3/ wrf/WRFV3/build_it.pbs.o5846442 wrf/WRFV3/build_it.pbs wrf/WRFV3/dyn_nmm/ wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_IGWAVE_ADJUST.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/nmm_loop_macros.h wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_MPP.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_PRECIP_ADJUST.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/RDTEMP.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_BNDRY_COND.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/adve_optim.h wrf/WRFV3/dyn_nmm/nmm_loop_basemacros.h wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_GWD.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_TIMERS.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_NONHY_DYNAM.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/BUCKETS.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_CLDWTR.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_NEST_UTIL.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/Makefile wrf/WRFV3/dyn_nmm/module_CTLBLK.F wrf/WRFV3/dyn_nmm/DSTRB.F 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deprecated. Please include your environment variables directly in your job script. INFO: Job submitted to account: jnd echo my job is $MYJOBID ~arnoldg/ior/wait_for.sh $MYJOBID my job is 8335401.bw === RUNNING /u/staff/arnoldg/ior/wait_for.sh === Fri Mar 23 23:44:53 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Fri Mar 23 23:49:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Fri Mar 23 23:54:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Fri Mar 23 23:59:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:04:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:09:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:14:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:19:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:24:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:29:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:34:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:39:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:44:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:49:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:54:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 00:59:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:04:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:09:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:14:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:19:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:24:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:29:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:34:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:39:54 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:44:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:49:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:54:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 01:59:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 02:04:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 02:09:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 02:14:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 02:19:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish Sat Mar 24 02:24:55 CDT 2018: waiting for 8335401.bw to finish qstat: Unknown Job Id Error 8335401.bw #echo "check for jobid manually and monitor progress, then check the output directory in ~bwjenkins/scratch/wrf-spp/APRIL_23..." ######## 8335401.bw finished [SSH] exit-status: 0 executing script: cd ~/scratch/wrf-spp/wrf/APRIL_23* TOTALTIME=`grep "WRF time" rsl.error.0000 | cut -d= -f2 | cut -d'.' -f1` echo YVALUE="$TOTALTIME" > ~/wrf-spp/totaltime.txt [SSH] exit-status: 0 [wrf-spp] $ /bin/sh -xe /tmp/jenkins4126631822893410452.sh + rm -rf /var/lib/jenkins/workspace/wrf-spp/totaltime.txt + scp 'BW_REMOTE:~/wrf-spp/totaltime.txt' /var/lib/jenkins/workspace/wrf-spp Access by OTP or Two Factor Certificate Authority only. Use myproxy-logon -s tfca.ncsa.illinois.edu -p 7512 for gsissh access. gsissh or ssh -o PreferredAuthentications=keyboard-interactive for otp access. Blue Waters Admin Team Recording plot data Saving plot series data from: /var/lib/jenkins/workspace/wrf-spp/totaltime.txt Finished: SUCCESS